Kubo fascinează oamenii din satul său cu darul său magic pentru învârtirea poveștilor sălbatice cu origami. Când a invocat din greșeală un spirit rău care caută răzbunare, Kubo este obligat să meargă într-o căutare pentru a rezolva misterul tatălui său samurai căzut și armamentul său mistic, precum și să-și descopere propriile puteri magice.